HEV感染中90%～95%为无症状，一小部分会引发急性戊型肝炎，而在免疫缺陷的人群中，例如肝移植或HIV感染者，疾病则会很容易转为慢性。在欧洲和美国，事实已经证明，这些免疫缺陷的患者可以发展成为慢性戊型肝炎。